El Museo Naval y el edificio del Cuartel General de la Armada forman parte de la declaración de Patrimonio Mundial Paseo del Prado y Buen Retiro. Paisaje de las Artes y las Ciencias.
España presentó en 2019 a la UNESCO la candidatura del Paseo del Prado y el Buen Retiro, paisaje de las Artes y las Ciencias, a la Lista del Patrimonio Mundial, por ser un paisaje cultural urbano extraordinario donde se han unido cultura y naturaleza desde mediados del siglo XVI hasta nuestros días. En julio de 2021, el Comité de Patrimonio Mundial ha inscrito la candidatura madrileña en la Lista de Patrimonio Mundial.
El Museo Naval propone en su exposición realizar un recorrido por la historia naval española, desde finales de la Edad Media hasta la actualidad, dando a conocer la contribución de la Armada al progreso social, cultural, económico, militar y científico de España y del mundo.
Los fondos del Museo Naval, que incluyen más de 12.000 piezas, se caracterizan por su riqueza y heterogeneidad, que es resultado de la propia historia de la Armada como institución. Entre ellos destacan por su importancia las colecciones de modelos de buques y de cartografía, que se encuentran entre las mejores del mundo. Otras tipologías bien representadas son las de instrumentos astronómicos, científicos y de navegación, artes plásticas y decorativas, armas y banderas, uniformes y condecoraciones, pertrechos marineros, piezas de etnografía y objetos personales de marinos ilustres, una diversidad de materiales que son la seña de identidad de la Institución.