En la Escuela de Suboficiales de la Armada se imparten los siguientes cursos correspondientes a la Enseñanza de Formación y Perfeccionamiento:
ENSEÑANZA DE FORMACIÓNCAES (Curso de acceso a la Escala de Suboficiales de los Cuerpos de Infantería de Marina y Especialistas de la Armada)(Fase común).
CMM (Curso de acceso a la Escala de Suboficiales de los Cuerpos Comunes de Músicas Militares)(Fase Armada).
ARV (Curso de formación básica militar para el acceso a la condición de reservista voluntario de la categoría de Suboficial de la Armada).
CASMA (Curso de actualización para el desempeño de los cometidos de Suboficial Mayor de la Armada).
CACBRI (Curso de actualización para el desempeño de los cometidos del empleo de Brigada).
CACMA (Curso de actualización para el desempeño de los cometidos de Cabo Mayor de la Armada).
La Jefatura de Estudios de la Escuela cuenta con cuatro departamentos para ejercer su labor:
DEPARTAMENTO DE IDIOMASEl Departamento de Idiomas tiene como misión la formación del alumno para que adquiera los conocimientos necesarios que le permitan comunicarse con un inglés adecuado a sus cometidos profesionales dentro de la Armada.
Cumple una triple función:
Personal e instalaciones
Para cumplir con sus misiones, el módulo de Idiomas cuenta con un Coordinador y seis Profesores titulados, así como con varios laboratorios digitales y multimedia, un aula de conversación con equipo de reproducción de películas, y aulas tradicionales.
Además, se cuenta con recursos para los Profesores y un fondo amplio de material de lectura y de ejercicios.
DEPARTAMENTO DE CONOCIMIENTOS CIENTIFICOS, NAVALES Y MILITARESEl Departamento de Conocimientos Científicos, Navales y Militares tiene como misión la formación de los alumnos en las áreas de conocimientos asignadas, para conseguir eficaces Suboficiales de la Armada, educándoles en el culto de las virtudes Militares y de las tradiciones de la Armada.
DEPARTAMENTO DE INSTRUCCIÓN Y ADIESTRAMIENTOEl Departamento de instrucción y adiestramiento, Navales y Militares tiene como misión la formación de los alumnos en las áreas de conocimientos asignadas, para conseguir eficaces suboficiales de la armada, educándoles en el culto de las virtudes Militares y de las tradiciones de la Armada.
En este departamento cabe destacar la formación de los alumnos CAES, tanto teórica como practica, en navegaciones a vela. Con participación en regatas gracias a los dos veleros, que para estos fines dispone la ESUBO.
DEPARTAMENTO DE SANIDADEl departamento de Sanidad tiene una doble función: docente y clínica.