Le corresponde la propuesta y control de los planes de investigación histórica que determine la Junta Facultativa y el despacho de las consultas de tipo histórico.
Entre 1895 y 1903 fueron apareciendo los 9 volúmenes de la obra de Cesáreo Fernández Duro “Armada Española, desde la unión de los reinos de Castilla y Aragón” que se inicia en 1474, con el reinado de los Reyes Católicos, y concluye en 1833 con la muerte de Fernando VII y la desaparición de la monarquía absoluta. El capitán de navío Fernández Duro, Secretario Perpetuo de la Real Academia de la Historia, fue un historiador de recopilación y de síntesis que paciente y sistemáticamente elaboró y ordenó documentación de las grandes colecciones de los marinos de Ilustración, Vargas Ponce, Navarrete y Sanz de Barutell, que se encuentran hoy en día en el Museo Naval de Madrid.
Agotada esta edición, en el año 1972, con ocasión de la celebración del IV centenario de la Batalla de Lepanto, el Museo Naval elaboró una reedición de la obra, que tuvo una gran acogida pero que también se encuentra con varios de sus volúmenes agotados, por lo que el Instituto de Historia y Cultura Naval considera oportuno ofrecer a todos los visitantes de esta página de la Armada esta misma obra, ahora en formato digital, con la esperanza de que sea de utilidad a todos los interesados en profundizar en el conocimiento de nuestra Historia Naval.
Este área organiza las Jornadas de Historia Marítima y es responsable de la edición de los Cuadernos Monográficos, con los contenidos de las conferencias impartidas durante las Jornadas y otros dedicados a algún personaje, acontecimiento o tema de interés.