El Departamento de Bibliotecas Navales del IHCN es responsable de la protección, conservación, catalogación, investigación y divulgación del patrimonio bibliográfico de la Armada.
El Departamento está integrado por la Biblioteca Central de Marina (Madrid) y las Bibliotecas Navales de San Fernando, Cartagena y Ferrol, todas ellas de carácter general y especializadas en bibliografía naval y marítima nacional e internacional.
Además, las bibliotecas de las diferentes escuelas de la Armada, la del Museo Naval, la del Real Observatorio de la Armada (San Fernando) y la del Instituto Hidrográfico de la Marina (Cádiz) dependen funcionalmente del Departamento a los efectos de control y gestión del valioso patrimonio bibliográfico que poseen.