Las exposiciones temporales son una forma de dar a conocer el Patrimonio Cultural de la Armada a través de estudios e investigaciones sobre temas diversos, acontecimientos históricos, conmemoraciones…
De esta forma el museo actualiza su oferta y ofrece nuevas historias a los visitantes con muestras monográficas o temáticas.
En la actualidad la sala de exposiciones temporales permanece cerrada tras el desmontaje de “Fuimos los primeros: Magallanes, Elcano y la vuelta al mundo”.