El Centro de Doctrina de la Flota (CEFLOT), al mando de un CN/COR IM, es el organismo de la Flota a través del cual el ALFLOT dirige, impulsa, coordina y controla el proceso de generación de Doctrina Táctica. Asimismo es responsable de la gestión de las observaciones y experiencias extraídas del análisis de las operaciones y ejercicios que elaboren los mandos de la Fuerza.
El CEFLOT también actúa como Secretaría Permanente de la Junta de Táctica, órgano de trabajo que proporciona los auxilios necesarios para el desarrollo de sus cometidos a la Junta.
Depende orgánicamente del ALFLOT y como Secretaría Permanente del Presidente de la Junta de Táctica de la Flota (PREJUTAC).
El CEFLOT para cumplir su misión tiene asignados tres cometidos de carácter general:
Coordinar y controlar la generación de Doctrina Táctica, y relacionarse con los organismos de generación de Doctrina Táctica nacional y aliada en nombre del ALFLOT, mediante la SECCIÓN DE DOCTRINA.
Gestionar el análisis de la Doctrina Táctica mediante el estudio de los Objetivos de Análisis, de las Lecciones Aprendidas, y de las conclusiones de los informes de análisis de ejercicios que efectúan los mandos orgánicos y operativos mediante la SECCIÓN DE ANÁLISIS.
Actuar como SECRETARÍA PERMANENTE de la JUTAC.
Presidida por un Oficial General de la Flota con mando, se estructura en: